Những sách đã xuất bản

• Bên bờ vịnh Rạch Giá (tập truyện)
• Thời gian gom nhặt (thơ)
• Trấn Hà Tiên và Tao Đàn Chiêu Anh Các (biên khảo)
• Nguyễn Thị Lộ (tiểu thuyết, 8 chương)[2] 07/2008
• Tìm lại cội nguồn người Việt (biên khảo, 7 chương)
• Hành trình tìm lại cội nguồn (nghiên cứu và đối thoại). Nhà xuất bản Văn học - 2007[3]
• Tìm cội nguồn qua di truyền học (2011)
• Viết lại lịch sử Trung Hoa.Nhà xuất bản SG, CA, USA, 2014.
• TIến trình lịch sử văn hoá Việt. Nhà xuất bản SG, CA, USA, 2014.
• Khám phá lịch sử Trung Hoa, Nhà xuất bản Hội Nhà văn, 2016.
• Tiền sử người Việt, Nhà xuất bản Hồng Đức, 2020.
• The Formation Process of the Origin an Culture of the Viet People. Nhà xuất bản Nhân Ảnh, 2020.
• Đối thoại, soi sáng lịch sử. Tập 1 và 2. Nhà xuất bản Nhân Ảnh, 2020.

Các tác phẩm khác

Hà Văn Thùy có rất nhiều các bài biên luận, đàm luận đăng trên các báo, tạp chí, các trang diễn đàn:

• Tìm lại cuội nguồn văn hóa của người Việt[4]
• Suy ngẫm về tiến trình văn minh nhân loại
• Bàn lại với giáo sư Lê Mạnh Thát
• Lâu đài trên mây hay dự cảm sáng suốt ?
• Thưa cùng giáo sư Lê Thành Khôi
• Nhà văn bút ngữ người thợ cày cần mẫn
• Nghi án quanh bài thơ cây chuối
• Tú Xương bi kịch trăm năm
• Di ngôn Phật sống Lưu Công Danh
• Hành trình tìm lại cội nguồn
• Khề khà cùng nhà văn Sơn Nam
• Trường Sa day dứt
• Chỉ mấy vần thơ mấy điệu ca
• Hồ Xuân Hương từ phản kháng đến nổi loạn
• Hai bài tiễn biệt trong thơ Ðường
• Researching for the ancestral and cultural origin of Vietnamese - the ancestral origin (11/2008)
• Sự hình thành dân cư Đông Á
• Giữ Tây Nguyên cho hôm nay và mai sau
• Đàn Xã Tắc thờ ai ? (04/2009)
• Văn chương Việt trong bối cảnh hậu hiện đại

Và rất nhiều các bài luận đàm khác.